Methylation of a panel of microRNA genes is a novel biomarker for detection of bladder cancer.
Shimizu T, Suzuki H, Nojima M, Kitamura H, Yamamoto E, Maruyama R, Ashida M, Hatahira T, Kai M, Masumori N, Tokino T, Imai K, Tsukamoto T, Toyota M.
Department of Urology, Sapporo Medical University, Sapporo, Japan.
Нарушение регуляции микроРНК вовлечено в развитие рака мочевого пузыря (РМП), хотя механизм до конца не изучен.
Цель
Нашей целью было исследовать участие эпигенетических изменений экспрессии микроРНК при РМП.
Дизайн исследования
Две клеточные линии (T24 и UM-UC-3) РМП обрабатывали 5-аза-2'-дезоксицитидином (5-аза-DC) и 4-фенилмасляной кислотой (ФМК), после чего профили экспрессии их микроРНК анализировали с использованием массива TaqMan (Life Technologies, Карлсбад, Калифорния, США). Пиросеквенирование бисульфитом было использовано для оценки метилирования гена микроРНК в 5 клеточных линиях рака, 83 первичных опухолей, 120 предоперационных и 47 послеоперационных образцах мочи.
Анализ ROC-кривой был использован для оценки диагностической точности панелей генов микроРНК.
Результаты
Из 664 изученных микроРНК 146 активировались 5-аза-DC плюс ФМК. CpG островки были идентифицированы в проксимальных отделах 23 генов микроРНК, 12 из них в клеточных линиях были гиперметилированы. Среди них микроРНК-137, miR-124-2, miR -124-3 и микроРНК-9-3 были часто и опухоль-специфически метилированы при первичном раке (miR -137: 68,7%: miR -124-2: 50,6 %: miR -124-3: 65,1%: miR -9-3: 45,8%). Метилирование тех же четырех микроРНК в образцах мочи приводило к обнаружению РМП с чувствительностью в 81% и специфичностью в 89%, площадь под ROC-кривой была 0,916. Эктопическая экспрессия неактивированных микроРНК в клетках РМП подавляла рост и инвазию клеток.
Выводы
Результаты показали, что эпигенетическая инактивация генов микроРНК может приводить к развитию РМП, а метилирование генов микроРНК может быть полезным биомаркером обнаружения рака.
Комментарии