This must be hidden
При поддержке препарата АФАЛАЗА

Характеризация клинических случаев рака собирательных трубочек почки с помощью полного геномного профилирования

19.09.2017
1722
0

Актуальность

Рак из собирательных трубочек (РСТ) является редким видом почечноклеточного рака (ПКР), происходищим из мозгового слоя почки. Клинические исходы неблагоприятны, а общепринятых рекомендаций по его терапии не существует.

Цель исследования

Определить геномные альтерации (ГА) в серии пациентов с местнораспространённым или метастатическим РСТ, у которых проводилось геномное профилирование на каком-либо этапе на протяжении лечения.

Дизайн, условия и участники исследования

Фиксированные в формалине и парафинированные блоки или стёкла были получены у 17 пациентов с РСТ. Была получена ДНК, выполнено полное геномное профилирование в лаборатории, сертифицированной по Clinical Laboratory Improvement Amendments.

Определение результатов и статистический анализ

Байесовские алгоритмы и алгоритмы локального выравнивания были использованы для выявления замен и инсерций / делеций соответственно. Сравнение с нормальными контрольными образцами было использовано для выявления альтераций количества копий. Клинически релевантные ГА (КРГА) были определены как те, которые можно связать с одобренными или изучаемыми видами таргетной терапии.

Результаты и ограничения

Медиана возраста в когорте составила 53 года (диапазон: 26–73), оценивались 14 первичных опухолей и три метастатических очага. Всего 36 ГА были выявлены в этой серии пациентов, со средним количеством 2.1 ГА на случай. Самые частые ГА наблюдались в NF2 (5/17, 29%), SETD2 (4/17, 24%), SMARCB1 (3/17, 18%) и CDKN2A (2/17, 12%). Девять случаев оценивались на ГА в FH, у двух пациентов была гомозиготная потеря FH. Ограничением было то, что выполнялась прицельная оценка генов, участвующих в патогенезе других видов рака, а поэтому мутации вне этого диапазона исключить было нельзя.

Заключение

Рецидивные КРГА были обнаружены в этой серии случаев РСТ и предполагают возможный положительный эффект от таргетной терапии. В частности, применение ингибиторов mTOR может быть интересным у пациентов с альтерациями NF2. Альтерации FH и SMARCB1 также отмечались взаимоисключающим образом с альтерациями NF2.

Ключевые слова: рак из собирательных трубочек, геномное профилирование, медуллярная карцинома, NF2.

Characterization of Clinical Cases of Collecting Duct Carcinoma of the Kidney Assessed by Comprehensive Genomic Profiling

By: Sumanta K. Pal, Toni K. Choueiri, Kai Wang, Depinder Khaira, Jose A. Karam, Eliezer Van Allen, Norma A. Palma, Mark N. Stein, Adrienne Johnson, Rachel Squillace, Julia A. Elvin, Juliann Chmielecki, Roman Yelensky, Evgeny Yakirevich, Doron Lipson, Douglas I. Lin, Vincent A. Miller, Philip J. Stephens, Siraj M. Ali  and Jeffrey S. Ross

  • a Department of Medical Oncology & Experimental Therapeutics, City of Hope Comprehensive Cancer Center, Duarte, CA, USA
  • b Division of Medical Oncology, Dana Farber Cancer Institute, Boston, MA, USA
  • c Foundation Medicine, Cambridge, MA, USA
  • d Department of Urology, University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA
  • e Department of Medical Oncology, Rutgers Cancer Institute of New Jersey, New Brunswick, NJ, USA
  • f Department of Pathology and Laboratory Medicine, Warren Alpert School of Medicine at Brown University, Providence, RI, USA
  • g Department of Pathology, Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, MA, USA
  • h Department of Pathology and Laboratory Medicine, Albany Medical College, Albany, NY, USA

European Urology, Volume 70 Issue 3, September 2016, Pages 516-521

Keywords: Collecting duct carcinoma, Genomic profiling, Medullary carcinoma, NF2

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич

Комментарии

European Urology (Европейская Урология) 2016, Cентябрь;
European Urology (Европейская Урология) 2016, Cентябрь;
Выпуски