This must be hidden
При поддержке препарата АФАЛАЗА

Систематическая оценка прогностической важности и внутриопухолевой гетерогенности биомаркеров светлоклеточного почечноклеточного рака

14.09.2015
2735
0

Актуальность

Для пациентов со светлоклеточным почечноклеточным раком (скПКР) идентифицирован ряд биомаркеров-кандидатов, но большинство из них не были валидизированы.

Цель исследования

Валидизировать прогностические биомаркеры при скПКР, данные по которым были ранее опубликованы, в независимой когорте пациентов и оценить внутриопухолевую гетерогенность (ВОГ) наиболее многообещающих маркеров чтобы направить процесс оптимизации биомаркерной диагностики.

Дизайн, условия и участники исследования

Онкоспецифическая выживаемость (ОСВ) для каждого из 28 идентифицированных генетических или транскриптомных биомаркеров была оценена у 350 пациентов с скПКР. ВОГ определялась по набору данных мультифокальной биопсии в 10 случаях скПКР.

Определение результатов и статистический анализ

Взаимосвязь экспрессии биомаркеров с ОСВ была проанализирована при унивариабельном и мультивариабельном анализах.

Результаты и ограничения

Всего 17 из 28 биомаркеров (мутации TP53; амплификации хромосом 8q, 12, 20q11.21q13.32 и 20; делеции 4p, 9p, 9p21.3p24.1 и 22q; низкая экспрессия EDNRB и TSPAN7; шесть сигнатур экспрессии генов) были валидизированы как предикторы плохой ОСВ в унивариабельном анализе. Только стадия опухоли и сигнатура экспрессии ccB были независимыми предикторами в мультивариабельном анализе. ВОГ сигнатуры ccB была идентифицирована в 8 из 10 опухолей. В образцах с экспрессией сигнатуры ccB были выражены в большей степени несколько генетических альтераций, которые были значимы при унивариабельном анализе, и были повышены индексы хромосомной нестабильности. Это исследование может быть недостаточно мощным для валидации биомаркеров с низкой встречаемостью.

Заключение

Сигнатура ccB была единственным независимым прогностическим биомаркером. Большая выраженность нескольких генетических альтераций, ассоциированных с плохим прогнозом, в образцах с ccB показала, что несколько клеточных событий могут требоваться для формирования этого агрессивного фенотипа, и в некоторых опухолях этот процесс катализируется хромосомной нестабильностью. Мультифокальная оценка может повысить точность этого биомаркера.

Ключевые слова: биомаркер, внутриопухолевая гетерогенность, рак почки, персонализированная медицина, прогностический маркер.

Systematic Evaluation of the Prognostic Impact and Intratumour Heterogeneity of Clear Cell Renal Cell Carcinoma Biomarkers

By: Sakshi Gulati a , Pierre Martinez b , Tejal Joshi c , Nicolai Juul Birkbak c , Claudio R. Santos b , Andrew J. Rowan b , Lisa Pickering d , Martin Gore d , James Larkin d , Zoltan Szallasi c e , Paul A. Bates a lowast , Charles Swanton b f and Marco Gerlinger b g

  • a Biomolecular Modelling Laboratory, Cancer Research UK London Research Institute, London, UK
  • b Translational Cancer Therapeutics Laboratory, Cancer Research UK London Research Institute, London, UK
  • c Centre for Biological Sequence Analysis, Technical University of Denmark, Lyngby, Denmark
  • d The Royal Marsden Hospital, London, UK
  • e Children's Hospital Informatics Program at the Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology, Harvard Medical School, Boston, MA, USA
  • f UCL Cancer Institute, London, UK
  • g Present address: Centre for Evolution and Cancer, The Institute of Cancer Research, London, UK

European Urology, Volume 66 Issue 5, November 2014, Pages 936-948

Keywords: Biomarker, Intratumour heterogeneity, Kidney cancer, Personalised medicine, Prognostic marker

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич

Комментарии

Журнал "Европейская Урология"
European Urology (Европейская урология) 2014 ноябрь;
Выпуски