Стромальная экспрессия генов предиктивна в отношении метастатического первичного рака простаты

01.06.2018
1936
0

Актуальность

Клинические системы градации, в которых используются клинические характеристики, так же как и номограммы, не имеют точности для направления принятия решения о лечении при раке предстательной железы (РПЖ). Существует критическая необходимость выявления биомаркеров, способных более точно стратифицировать мужчин с первичным РПЖ.

Цель исследования

Выявить эффективную прогностическую сигнатуру, способную лучше различать индолентный и агрессивный рак предстательной железы (РПЖ).

Дизайн, условия и участники исследования

Для разработки сигнатуры было проведено секвенирование целого генома и целого транскриптома на пяти моделях РПЖ с ксенографтами от пациентов (ПГ), полученными из независимых фокусов одной первичной опухоли и демонстрирующими различные метастатические фенотипы. Несколько независимых клинических когорт, включая когорту промежуточного риска, были использованы для валидации биомаркеров.

Определение результатов и статистический анализ

Метастазирование после радикальной простатэктомии было исходом, который определял агрессивный РПЖ. Общая линейная модель с лассо-регуляризацией была использована для построения стромальной сигнатуры метастазирования из 93 генов (SDMS). Ассоциация между SDMS и метастазированием оценивалась с помощью теста суммы рангов Уилкоксона. Эффективность оценивалась с использованием площади под кривой (AUC) для рабочей характеристики приёмника и кривых Каплана-Мейера. Унивариабельная и мультивариабельная регрессионные модели были использованы для сравнения SDMS с клиникогистологическими переменными и другими сигнатурами. AUC оценивалась для определения того, является ли SDMS аддитивной или синергистичной по отношению к другим ранее определённым сигнатурам.

Результаты и ограничения

Наблюдалась тесная ассоциация между стромальной экспрессией генов и метастатическим фенотипом. Соответственно, моделировалась и была валидизирована SDMS в нескольких независимых клинических когортах. Пациенты с высокими показателями SDMS, как выяснилось, имели худший прогноз. Более того, SDMS была независимым прогностическим фактором, была способна стратифицировать риск при РПЖ промежуточного риска и может улучшать эффективность других ранее представленных сигнатур.

Заключение

Профилирование стромальной экспрессии генов привело к разработке SDMS, которая была валидизирована как независимый прогностический фактор для метастатического потенциала опухолей простаты.

Ключевые слова: стромальные гены, метастазирование рака простаты, прогностические биомаркеры, геномное профилирование, РНК-секвенирование.

Stromal Gene Expression is Predictive for Metastatic Primary Prostate Cancer

By: Fan Mo, Dong Lin, Mandeep Takhar, Varune Rohan Ramnarine, Xin Dong, Robert H. Bell, Stanislav V. Volik, Kendric Wang, Hui Xue, Yuwei Wang, Anne Haegert, Shawn Anderson, Sonal Brahmbhatt, Nicholas Erho, Xinya Wang, Peter W. Gout, James Morris, R. Jeffrey Karnes, Robert B. Den, Eric A. Klein, Edward M. Schaeffer, Ashley Ross, Shancheng Ren, S. Cenk Sahinalp, Yingrui Li, Xun Xu, Jun Wang, Jian Wang, Martin E. Gleave, Elai Davicioni, Yinghao Sun, Yuzhuo Wang, Colin C. Collins

European Urology, Volume 73 Issue 4, April 2018, Pages 524–532

Keywords: Stromal gene, Prostate cancer metastasis, Prognostic biomarkers, Genomic profiling, RNA sequencing

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич

Комментарии

European Urology (Европейская Урология) 2018 Апрель
European Urology (Европейская Урология) 2018 Апрель
Выпуски