Геномная характеристика уротелиальной карциномы верхних мочевыводящих путей

27.02.2016
1878
0

Актуальность

Несмотря на схожесть гистологической картины, уротелиальная карцинома верхних мочевыводящих путей (УКВМП) и уротелиальная карцинома мочевого пузыря (УКМП) имеют чёткие эпидемиологические и клиникоморфологические различия.

Цель исследования

Изучить, являются ли различия между УКВМП и УКМП следствием внутренней биологической разнородности.

Дизайн, условия и участники исследования

Опухолевая и соматическая ДНК пациентов с УКВМП (n = 83) и УКМП (n = 102) были проанализированы с помощью специального набора для секвенирования следующего поколения с целью выявления соматических мутаций и изменения количества копий по 300 генам, ассоциированным с раком.

Определение результатов и статистический анализ

Мы описали закономерности сочетанных мутаций и изменения количества копий при УКВМП. Мы также сравнили частоту мутаций при низкодифференцированной УКВМП (n = 59) и низкодифференцированной УКМП (n = 102).

Результаты и ограничения

Сравнение низкодифференцированных УКВМП и УКМП показало значимые различия по встречаемости соматических мутаций. Гены, наиболее часто альтерированные при низкодифференцированной УКВМП, включали в себя FGFR3 (35.6% против 21.6%; p = 0.065), HRAS (13.6% против 1.0%; p = 0.001) и CDKN2B (15.3% против 3.9%; p = 0.016). Гены, менее часто мутировавшие при низкодифференцированной УРВМП, включали TP53 (25.4% против 57.8%; p  .1), RB1 (0.0% против 18.6%; p  .1) и ARID1A (13.6% против 27.5%; p = 0.050). Поскольку возможности нашего набора были ограничены прицельным определением геномных альтераций в заданной панели, редкие мутации и эпигенетические изменения не были анализированы.

Заключение

Низкодифференцированные УКВМП-опухоли демонстрируют целый спектр разнообразных генетических альтераций, сходный с таковым при низкодифференцированном УКМП. Однако, были значительные различия встречаемости нескольких стойко мутировавших генов, в число которых вошли HRAS, TP53 и RB1. Пока разрабатываются и тестируются релевантные таргетные ингибиторы, эти результаты могут в дальнейшем сыграть важную роль в ведении пациентов с уротелиальной карциномой.

Ключевые слова: уротелиальная карцинома верхних мочевыводящих путей, геномика, рак мочевого пузыря, таргетная терапия.

Genomic Characterization of Upper Tract Urothelial Carcinoma

By: John P. Sfakianos a b , Eugene K. Cha a , Gopa Iyer c d , Sasinya N. Scott e , Emily C. Zabor f , Ronak H. Shah e , Qinghu Ren e , Aditya Bagrodia a , Philip H. Kim a , A. Ari Hakimi a , Irina Ostrovnaya f , Ricardo Ramirez g , Aphrothiti J. Hanrahan g , Neil B. Desai h , Arony Sun a , Patrizia Pinciroli g i , Jonathan E. Rosenberg c d , Guido Dalbagni a d , Nikolaus Schultz j , Dean F. Bajorin c d , Victor E. Reuter e d , Michael F. Berger d e g , Bernard H. Bochner a d , Hikmat A. Al-Ahmadie e , David B. Solit c d g and Jonathan A. Coleman a d

  • a Department of Surgery, Urology Service, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY, USA
  • b Department of Urology, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY, USA
  • c Department of Medicine, Genitourinary Oncology Service, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY, USA
  • d Weill Medical College of Cornell University, New York, NY, USA
  • e Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY, USA
  • f Department of Epidemiology and Biostatistics, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY, USA
  • g Human Oncology and Pathogenesis Program, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY, USA
  • h Department of Radiation Oncology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY, USA
  • i Fondazione IRCCS Istituto Nazionale dei Tumori, Milan, Italy
  • j Department of Epidemiology and Biostatistics, Computational Oncology Service, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY, USA

European Urology, Volume 68 Issue 6, December 2015, Pages 970-977

Keywords: Upper tract urothelial carcinoma, Genomics, Bladder cancer, Targeted therapy

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич

Комментарии

Журнал "Европейская Урология"
European Urology (Европейская урология) 2015 Декабрь; 68(6)
Выпуски